Durch hartes und intensives Arbeiten und Forschen in den MINT-Fächern, vor allem in den Bereichen Biologie, Informatik, Technik und Physik und der Suche nach Antworten im Bereich der Nachhaltigkeit und Ethik, darf sich St. Gertrudis seit 2018 MINT-freundliche Schule nennen.
Seit 2010 besitzt die Schule eine Jugend forscht-AG, in der zahlreiche SchülerInnen erfolgreich an vielen Projekten arbeiten. St. Gertrudis pflegt engen Kontakt mit verschiedenen Wirtschaftspartnern, Universitäten und Hochschulen. Mehrere Projekte wurden von der Baden-Württemberg-Stiftung mikromakro finanziert. Ebenso ist die erfolgreiche Teilnahme an verschiedenen Wettbewerben wie Jugend forscht/Jugend experimentiert, Junior.ING BW, Tag der Mathematik und Physik im Advent Bestandteil der Aktivitäten im MINT-Bereich.